More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3223 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  76.19 
 
 		 106 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  88.04 
 
 		 106 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  81.82 
 
 		 113 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 104 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  60 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  54.81 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 116 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  51.55 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  47.42 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  49.48 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  51.58 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  47.47 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  48.35 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  45 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  47.71 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  48.98 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  48.48 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  46.46 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  50.56 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  48.48 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  51.19 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  46.99 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  48.94 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  53.33 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  48.96 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  48.24 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  43.3 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  39.78 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 116 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 101 aa  84.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 		 99 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 		 99 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  38 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  38.54 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>