More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3152 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
235 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  81.01 
 
 
237 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  81.86 
 
 
239 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  78.24 
 
 
239 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  64.73 
 
 
234 aa  313  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  62.45 
 
 
239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.57 
 
 
235 aa  289  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.48 
 
 
235 aa  286  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  58.7 
 
 
235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  57.83 
 
 
235 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.65 
 
 
235 aa  278  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  58.77 
 
 
233 aa  277  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.27 
 
 
232 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  57.52 
 
 
230 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  56.96 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.46 
 
 
261 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  59.43 
 
 
214 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  56.44 
 
 
229 aa  268  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  56.7 
 
 
230 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  54.59 
 
 
232 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.02 
 
 
233 aa  266  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  57.46 
 
 
233 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.22 
 
 
237 aa  266  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.44 
 
 
236 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.08 
 
 
233 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  56.25 
 
 
230 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  54.39 
 
 
229 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  57.96 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  58.49 
 
 
213 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.74 
 
 
231 aa  264  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  56.77 
 
 
236 aa  263  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 
232 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  55.65 
 
 
232 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  54.98 
 
 
235 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 
232 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 
232 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 
232 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  54.91 
 
 
230 aa  262  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  58.96 
 
 
213 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  55.65 
 
 
232 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  56.33 
 
 
236 aa  262  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.59 
 
 
231 aa  261  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  56.25 
 
 
230 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  53.74 
 
 
229 aa  260  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.25 
 
 
230 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  56.19 
 
 
233 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.25 
 
 
230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  53.78 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  53.48 
 
 
232 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.7 
 
 
230 aa  258  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  52.61 
 
 
239 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.8 
 
 
230 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  54.91 
 
 
230 aa  255  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.75 
 
 
233 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  52.17 
 
 
232 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  55.36 
 
 
230 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.36 
 
 
230 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  54.42 
 
 
229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  56 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  53.57 
 
 
230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  56.5 
 
 
234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  50.64 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.91 
 
 
230 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  53.3 
 
 
229 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.96 
 
 
242 aa  250  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.81 
 
 
263 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.46 
 
 
231 aa  245  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.41 
 
 
211 aa  245  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  59.41 
 
 
211 aa  245  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  55.5 
 
 
209 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  59.9 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  55.77 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  55.87 
 
 
220 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.88 
 
 
209 aa  241  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  55.87 
 
 
220 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  52.4 
 
 
208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  56.37 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  58.38 
 
 
233 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  58.42 
 
 
236 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  52.4 
 
 
208 aa  235  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.46 
 
 
211 aa  234  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  56.35 
 
 
215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  55.33 
 
 
215 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  55.33 
 
 
215 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  55.33 
 
 
215 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  55.33 
 
 
215 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  55.33 
 
 
215 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  55.84 
 
 
215 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  55.84 
 
 
215 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  55.84 
 
 
215 aa  229  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  56.35 
 
 
215 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  55.84 
 
 
215 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.37 
 
 
241 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  55.84 
 
 
215 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  55.84 
 
 
215 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  55.84 
 
 
215 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  51.82 
 
 
222 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.98 
 
 
233 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.94 
 
 
222 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  51.09 
 
 
228 aa  228  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>