More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3046 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 722 aa  1468    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  42.19 
 
 		 680 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  34.78 
 
 		 691 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 662 aa  303  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.94 
 
 		 685 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  30.44 
 
 		 673 aa  263  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 669 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 671 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.92 
 
 		 715 aa  196  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 666 aa  177  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 732 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 720 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 687 aa  170  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 853 aa  163  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 695 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 704 aa  161  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 710 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 851 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 694 aa  158  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 703 aa  158  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 693 aa  154  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 759 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 690 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 695 aa  150  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 685 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.57 
 
 		 755 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 752 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 758 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 741 aa  146  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 758 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 690 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 750 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 722 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 794 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 784 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 730 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 735 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 802 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 751 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 771 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 728 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 713 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 734 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 790 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 788 aa  137  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 790 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 728 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 787 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 753 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 761 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 757 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 641 aa  134  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 753 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 798 aa  134  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 753 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 766 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 778 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 775 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 780 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 730 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 713 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 700 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.94 
 
 		 822 aa  129  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 736 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 738 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 794 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 758 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 747 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 710 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 723 aa  127  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 777 aa  126  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 774 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 786 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 732 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 717 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 757 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 726 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 780 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 778 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 731 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 755 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 766 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 763 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 764 aa  121  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 719 aa  121  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 755 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 803 aa  120  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 744 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 722 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 686 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 726 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 712 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 774 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>