More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3036 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  49.2 
 
 		 4268 aa  1336    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  40.88 
 
 		 2006 aa  823    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.58 
 
 		 6889 aa  865    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  36.34 
 
 		 2057 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  34.95 
 
 		 2374 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.92 
 
 		 3099 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  45.25 
 
 		 2619 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  43.1 
 
 		 3021 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  36.3 
 
 		 1548 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 2551 aa  695    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.87 
 
 		 1874 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.5 
 
 		 1656 aa  1070    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  39.38 
 
 		 1845 aa  821    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.82 
 
 		 1587 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  41.75 
 
 		 3739 aa  781    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  40.74 
 
 		 2103 aa  779    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  40 
 
 		 1514 aa  751    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42 
 
 		 3176 aa  651    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  43.3 
 
 		 3002 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  35.7 
 
 		 1824 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  36.02 
 
 		 3194 aa  776    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  41.11 
 
 		 3252 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  28.7 
 
 		 4101 aa  931    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  43.71 
 
 		 1337 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  43.67 
 
 		 2230 aa  782    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  35.79 
 
 		 1825 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.47 
 
 		 1559 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  41.14 
 
 		 1884 aa  867    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  100 
 
 		 4165 aa  8344    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  32.88 
 
 		 2243 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  31.44 
 
 		 3718 aa  746    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  46.15 
 
 		 2174 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  29.59 
 
 		 1497 aa  651    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  35.42 
 
 		 1825 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.38 
 
 		 3693 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  44.88 
 
 		 2310 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  36.65 
 
 		 2035 aa  1098    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37.11 
 
 		 2880 aa  764    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  45.81 
 
 		 2350 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  33.87 
 
 		 1862 aa  796    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.55 
 
 		 1087 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.17 
 
 		 1354 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  39.85 
 
 		 1835 aa  900    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.46 
 
 		 4478 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  38.21 
 
 		 1474 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  37.17 
 
 		 1809 aa  723    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  35.42 
 
 		 1825 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.24 
 
 		 1559 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.38 
 
 		 3693 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 		 7279 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  40.07 
 
 		 1734 aa  870    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  34.18 
 
 		 1888 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  41.52 
 
 		 3676 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  41.22 
 
 		 3696 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  37.12 
 
 		 1809 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  35.59 
 
 		 2896 aa  681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  34.17 
 
 		 1581 aa  685    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  39.78 
 
 		 1837 aa  818    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  31.05 
 
 		 1889 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 3092 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  36.55 
 
 		 2200 aa  1067    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  34.29 
 
 		 3875 aa  930    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  46.1 
 
 		 2258 aa  691    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 2376 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  41.76 
 
 		 1157 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.38 
 
 		 3702 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  42.52 
 
 		 2232 aa  643    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  43.56 
 
 		 2706 aa  748    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.39 
 
 		 2762 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  33.14 
 
 		 3158 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  32.62 
 
 		 2226 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  41.76 
 
 		 1157 aa  718    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.17 
 
 		 1372 aa  637  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  41.38 
 
 		 1487 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  40 
 
 		 1349 aa  632  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  41.88 
 
 		 1131 aa  628  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  33.93 
 
 		 1520 aa  630  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  33.93 
 
 		 1520 aa  630  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  34.45 
 
 		 1812 aa  629  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.54 
 
 		 1349 aa  630  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.81 
 
 		 3679 aa  630  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  33.97 
 
 		 1537 aa  626  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  40.71 
 
 		 3337 aa  619  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  42.83 
 
 		 2477 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  42.26 
 
 		 2230 aa  616  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  39.27 
 
 		 3293 aa  617  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  39.13 
 
 		 1897 aa  612  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  42.98 
 
 		 1113 aa  613  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  40.5 
 
 		 3099 aa  613  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  37.39 
 
 		 2336 aa  609  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.65 
 
 		 1939 aa  609  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  43.27 
 
 		 3645 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 5154 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  40.52 
 
 		 1174 aa  607  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  40.1 
 
 		 1678 aa  607  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  37.18 
 
 		 2345 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  41.41 
 
 		 2084 aa  603  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  41.58 
 
 		 1894 aa  602  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  38.95 
 
 		 3130 aa  603  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.91 
 
 		 1804 aa  602  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>