212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2962 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  78.31 
 
 		 179 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  77.71 
 
 		 157 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  73.05 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  46.15 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 202 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  52.05 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  43.94 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 120 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 148 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  40.74 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  37.91 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  48.45 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  48.94 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  32.46 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  35.51 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  21.58 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  24.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 145 aa  47.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  24.79 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  23.19 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  20.72 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  32.38 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  22.54 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 219 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>