116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2921 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  71.16 
 
 
575 aa  843    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  100 
 
 
593 aa  1224    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  58.3 
 
 
590 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  41.9 
 
 
550 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  41.62 
 
 
537 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.26 
 
 
538 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  39.67 
 
 
547 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  36.36 
 
 
555 aa  357  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  36.59 
 
 
544 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  38.43 
 
 
543 aa  340  5e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  36.94 
 
 
544 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  36.84 
 
 
531 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.97 
 
 
541 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.57 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  32.86 
 
 
555 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.98 
 
 
538 aa  200  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  25.97 
 
 
531 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.68 
 
 
576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.95 
 
 
1349 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.76 
 
 
1391 aa  94  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.78 
 
 
553 aa  91.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.37 
 
 
1570 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  22.82 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.37 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  22.27 
 
 
554 aa  77.4  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  22.86 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.64 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  25 
 
 
569 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.11 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  22.46 
 
 
585 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.55 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.04 
 
 
747 aa  67.4  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  24.74 
 
 
548 aa  67  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.09 
 
 
608 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.67 
 
 
572 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.34 
 
 
571 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.74 
 
 
584 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.17 
 
 
567 aa  65.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.2 
 
 
692 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  23.28 
 
 
602 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  40.48 
 
 
599 aa  64.3  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 
639 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.56 
 
 
557 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  25.5 
 
 
608 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  24.17 
 
 
582 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.22 
 
 
580 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.45 
 
 
585 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.71 
 
 
560 aa  60.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.76 
 
 
583 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  20.74 
 
 
550 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.44 
 
 
575 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  24.69 
 
 
590 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  24.76 
 
 
586 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  23.42 
 
 
578 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  24.76 
 
 
586 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  21.82 
 
 
692 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.36 
 
 
592 aa  55.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  25.74 
 
 
562 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  25.74 
 
 
562 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  19.56 
 
 
558 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  25.62 
 
 
584 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  21.99 
 
 
570 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  24.52 
 
 
558 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.33 
 
 
597 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  21.48 
 
 
556 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  24.76 
 
 
585 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  21.69 
 
 
567 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  24.76 
 
 
568 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.81 
 
 
567 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.95 
 
 
578 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.64 
 
 
586 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  24.27 
 
 
585 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  23.93 
 
 
590 aa  50.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  18.65 
 
 
595 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  38.24 
 
 
561 aa  50.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  23.03 
 
 
583 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  21.46 
 
 
567 aa  50.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  21.46 
 
 
567 aa  50.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  22.56 
 
 
575 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20 
 
 
554 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.3 
 
 
584 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.55 
 
 
593 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 
595 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.66 
 
 
610 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.05 
 
 
568 aa  47.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  19.55 
 
 
596 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  19.55 
 
 
596 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.31 
 
 
554 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.99 
 
 
595 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  22.66 
 
 
583 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  23.28 
 
 
565 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.86 
 
 
562 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.62 
 
 
554 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  21.61 
 
 
595 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  23.28 
 
 
562 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20 
 
 
554 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  25.24 
 
 
561 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  19.55 
 
 
596 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.47 
 
 
585 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  20.74 
 
 
539 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>