More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2886 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  76.45 
 
 		 312 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  80.86 
 
 		 312 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  70.65 
 
 		 312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 315 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  55.41 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  55.41 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  53.57 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  53.11 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  53.23 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  53.23 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  49.51 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  48.55 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  48.71 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  48.87 
 
 		 314 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  47.1 
 
 		 311 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  45.81 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  48.06 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 342 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  46.13 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  46.77 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  48.23 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  45.34 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  45.11 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.05 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  43.31 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45 
 
 		 318 aa  249  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  46.77 
 
 		 327 aa  245  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 387 aa  245  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  43.73 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  46.5 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 		 338 aa  238  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  42.72 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  45.48 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 315 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  45.66 
 
 		 369 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.66 
 
 		 369 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  45.66 
 
 		 374 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  41.61 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.08 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 323 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  48.38 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  44.81 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  43.09 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 		 332 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  40.44 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  45.11 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  43.49 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  41.93 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>