More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2826 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  77.27 
 
 		 176 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  75 
 
 		 176 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  74.43 
 
 		 176 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  70.45 
 
 		 176 aa  258  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  69.71 
 
 		 176 aa  250  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  76.14 
 
 		 176 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  58.33 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  50.31 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  49.67 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  59.74 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  59.74 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  59.74 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  49.37 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  49.37 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  48.73 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  53.64 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  50.94 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  42.35 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  42.35 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  50.99 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  51.57 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 671 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  40.74 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.88 
 
 		 676 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  41.98 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  34.48 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  33.91 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.53 
 
 		 668 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  40.36 
 
 		 681 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.89 
 
 		 664 aa  114  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  34.48 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  40.94 
 
 		 678 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  40.94 
 
 		 678 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  37.13 
 
 		 686 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  41.51 
 
 		 241 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  36.88 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.41 
 
 		 664 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.07 
 
 		 662 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  34.94 
 
 		 695 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  35.58 
 
 		 254 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  35.58 
 
 		 254 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  35.58 
 
 		 254 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  34.97 
 
 		 256 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  35.58 
 
 		 254 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  35.58 
 
 		 254 aa  98.2  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  35.58 
 
 		 254 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  35.58 
 
 		 254 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  35.58 
 
 		 254 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.36 
 
 		 254 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  35.06 
 
 		 255 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  31.9 
 
 		 255 aa  96.3  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  33.96 
 
 		 255 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 682 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  38.89 
 
 		 682 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  32.52 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  33.56 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  32.52 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  32.52 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  32.52 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.99 
 
 		 469 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  32.52 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  33.56 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 		 255 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.65 
 
 		 483 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.84 
 
 		 684 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.74 
 
 		 256 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  34.84 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 256 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  34.62 
 
 		 641 aa  91.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  34.84 
 
 		 684 aa  91.7  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  35.9 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 438 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  41.38 
 
 		 677 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  40 
 
 		 672 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0937  hypothetical protein  34.44 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  39.31 
 
 		 672 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.87 
 
 		 664 aa  77.8  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  29.05 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  32.43 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  29.05 
 
 		 437 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  34.71 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.43 
 
 		 438 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  31.36 
 
 		 230 aa  73.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  32.09 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  38.62 
 
 		 672 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  33.83 
 
 		 438 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  32.05 
 
 		 439 aa  67.8  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  36.75 
 
 		 672 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  40.44 
 
 		 672 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  32.17 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  39.31 
 
 		 672 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  26.28 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  31.72 
 
 		 438 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1909  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.1 
 
 		 250 aa  64.7  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000434207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.61 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  31.88 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  34.59 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  31.85 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>