More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2822 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  73.74 
 
 		 199 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  72.22 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  62 
 
 		 200 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  53.61 
 
 		 195 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  53.4 
 
 		 195 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  50.77 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  47.21 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  46.07 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  45.51 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  42.94 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  41.43 
 
 		 1287 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  38.41 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  34.46 
 
 		 192 aa  97.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  38.73 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  39.57 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  41.98 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  30.56 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  30.56 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  28.66 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  30.6 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  36.22 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  34.53 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  32.56 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  38.33 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  38.06 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  32.85 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.13 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  31.85 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  34.38 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  30.36 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  29.21 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  31.97 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.39 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  32.69 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.12 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  31.18 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  32.14 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.88 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  32.14 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  32.14 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  29.89 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  40.19 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  35.57 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  38 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  26.42 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  29.89 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  29.89 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  30.19 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  29.89 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>