293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2777 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  84.87 
 
 		 118 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  71.13 
 
 		 133 aa  193  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  84.11 
 
 		 133 aa  190  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  73.47 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  73.43 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  70.87 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  60.55 
 
 		 111 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  59.46 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  59.09 
 
 		 110 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  59.46 
 
 		 113 aa  140  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  59.46 
 
 		 113 aa  139  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  61.47 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  63.96 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  59.63 
 
 		 110 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  59.63 
 
 		 110 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  60.91 
 
 		 114 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  55.45 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  61.8 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  58.26 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  43.06 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  50.88 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  60.95 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  54.74 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  58.82 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  56.47 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  56.47 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  42.98 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  55.29 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  48.11 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  52.94 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  52.38 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  52.94 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  42.06 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  47.78 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  43.36 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  43.18 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  43.56 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  40.38 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  39.6 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  45.65 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  35.66 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  45.28 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  39.45 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  41.57 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  45.92 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  40.22 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  42.53 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  41.84 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  45.98 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  38.83 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  40.82 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  41.12 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  41.12 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  41.12 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  39.05 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  39.8 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>