More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2579 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  74.77 
 
 
784 aa  1115  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  84.34 
 
 
762 aa  1273  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 
763 aa  645  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  76.5 
 
 
764 aa  1166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  76.73 
 
 
766 aa  1102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.06 
 
 
745 aa  776  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  84.66 
 
 
762 aa  1247  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
761 aa  1520  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  82.96 
 
 
763 aa  1253  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
779 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 
755 aa  635  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  45.91 
 
 
774 aa  635  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
771 aa  631  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  45.3 
 
 
774 aa  631  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 
753 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 
814 aa  613  1e-174  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
757 aa  602  1e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
779 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  46.64 
 
 
759 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 
799 aa  595  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  47.92 
 
 
799 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
756 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.1 
 
 
799 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 
756 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
757 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  41.55 
 
 
742 aa  554  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
754 aa  467  1e-130  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
740 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
753 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
753 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
747 aa  446  1e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
769 aa  449  1e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
759 aa  441  1e-122  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
760 aa  440  1e-122  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
756 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  37.34 
 
 
767 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.09 
 
 
752 aa  417  1e-115  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
768 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
753 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
742 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  32.47 
 
 
714 aa  372  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  31.75 
 
 
713 aa  364  3e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
773 aa  355  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
756 aa  306  8e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
752 aa  273  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19377e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
738 aa  265  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  6.23284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
731 aa  265  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
749 aa  264  5e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.18 
 
 
748 aa  261  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.59 
 
 
756 aa  260  5e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
733 aa  257  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
741 aa  255  2e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
756 aa  255  2e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
748 aa  251  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
733 aa  247  5e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
737 aa  247  7e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
736 aa  244  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
746 aa  242  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
729 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
736 aa  227  5e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
845 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  28.39 
 
 
710 aa  226  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
710 aa  225  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
816 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
736 aa  226  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
734 aa  220  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
775 aa  219  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 
725 aa  218  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  33.58 
 
 
712 aa  217  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
744 aa  211  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
776 aa  210  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
781 aa  209  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
708 aa  207  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  5.83847e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
827 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
804 aa  205  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
718 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
765 aa  204  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  30.06 
 
 
787 aa  204  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  30.18 
 
 
802 aa  204  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  30.18 
 
 
802 aa  204  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  32.29 
 
 
734 aa  204  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  30.18 
 
 
787 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
800 aa  203  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  30.06 
 
 
802 aa  202  1e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  30.06 
 
 
802 aa  202  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  30.06 
 
 
802 aa  202  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  30.06 
 
 
806 aa  202  2e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 
770 aa  201  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
800 aa  199  1e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
817 aa  199  2e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
756 aa  199  2e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
803 aa  197  5e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
764 aa  197  8e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  25.62 
 
 
705 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
764 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
804 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
765 aa  196  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
804 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
804 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
804 aa  193  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>