242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2304 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00318843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  84.07 
 
 		 295 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2471  hypothetical protein  82.37 
 
 		 295 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2975  hypothetical protein  81.36 
 
 		 295 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2349  hypothetical protein  77.63 
 
 		 295 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  72.88 
 
 		 295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3822  hypothetical protein  76.61 
 
 		 295 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3135  hypothetical protein  51.54 
 
 		 310 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  50.17 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  49.83 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  49.83 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1534  hypothetical protein  48.65 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0415329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0758  hypothetical protein  47.8 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  48.31 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  47.16 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3719  hypothetical protein  45.58 
 
 		 304 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  49.49 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  47.64 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1061  hypothetical protein  48.65 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1204  hypothetical protein  47.12 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3355  hypothetical protein  48.82 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0428  hypothetical protein  45.85 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1764  hypothetical protein  45.08 
 
 		 295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58123  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  43.58 
 
 		 294 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  43.88 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  43.54 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1219  hypothetical protein  44.03 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.237953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2522  hypothetical protein  42.57 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  41.33 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  43.19 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1267  hypothetical protein  40.2 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  37.79 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  37.79 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1103  hypothetical protein  38 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  36.61 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  34.56 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  34.56 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  35.69 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  34.46 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  34.56 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  35.93 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  37.29 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  37.46 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  35.23 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  35.23 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  35.23 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  35.59 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  35.23 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  35.23 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  34.69 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  33.9 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  35.25 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  37.12 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  36.79 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  35.14 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  35.55 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  36.61 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  34.23 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  38.64 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  34.77 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  39.43 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  34.33 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  33.44 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  34.69 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  34.33 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  32.99 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  32.65 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  36.21 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  34.33 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  32.77 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  32.77 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  34.25 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  32.77 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  37.37 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  34.54 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  35.23 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  32.56 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  32.66 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  33 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  34.58 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  35.67 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  35.67 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  35.71 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  33.89 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  29.63 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  33.88 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  33.88 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  34.45 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  32.99 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  35.57 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  35.71 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  32.31 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  36.7 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  34.67 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  31.97 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  31.97 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  31.97 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>