More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2222 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2222  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0138453  normal  0.531895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  88.75 
 
 		 592 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  88.75 
 
 		 574 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  85 
 
 		 576 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  83.75 
 
 		 575 aa  140  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  84.34 
 
 		 581 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  83.75 
 
 		 574 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  55 
 
 		 571 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  40.7 
 
 		 587 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  39.53 
 
 		 586 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  39.53 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.29 
 
 		 587 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  39.53 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  40.48 
 
 		 585 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.1 
 
 		 587 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  40.48 
 
 		 585 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  38.37 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 656 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 		 548 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  44.93 
 
 		 547 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  44.93 
 
 		 547 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 		 762 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  43.04 
 
 		 741 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  42.19 
 
 		 541 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  35.53 
 
 		 586 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 		 457 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 572 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  32.05 
 
 		 585 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 		 585 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  40.68 
 
 		 688 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  55.1 
 
 		 617 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 		 585 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  36.11 
 
 		 424 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  46.55 
 
 		 579 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  39.47 
 
 		 684 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 		 674 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  36 
 
 		 574 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  42.31 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.96 
 
 		 567 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1708  potassium efflux system protein  55.1 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 		 567 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  41.82 
 
 		 665 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  40.68 
 
 		 666 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  36.11 
 
 		 572 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  38.37 
 
 		 741 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119547  potassium:hydrogen antiporter, putative  37.33 
 
 		 671 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.2676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  41.82 
 
 		 665 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 		 710 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 566 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  43.4 
 
 		 657 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 566 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  48.98 
 
 		 585 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 741 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 566 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  53.06 
 
 		 607 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  42.59 
 
 		 662 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 		 613 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 		 567 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2592  potassium efflux system protein  34.67 
 
 		 632 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  48.15 
 
 		 604 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2815  potassium efflux system protein  34.67 
 
 		 632 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.02 
 
 		 620 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 		 771 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  48.98 
 
 		 595 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  48.98 
 
 		 595 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  45.1 
 
 		 682 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 666 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5156  potassium efflux system protein  48.98 
 
 		 595 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.458112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7264  potassium efflux system protein  36.62 
 
 		 630 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 606 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  35.8 
 
 		 562 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 664 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 757 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  36.99 
 
 		 570 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 		 775 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  41.1 
 
 		 661 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 606 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2620  potassium efflux system protein  33.33 
 
 		 632 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  48.15 
 
 		 601 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  48.15 
 
 		 601 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  43.86 
 
 		 699 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 		 595 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>