More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2220 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  62.09 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  59.05 
 
 		 249 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.28 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.28 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.28 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.08 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.91 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.62 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  36.71 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.65 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.54 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.3 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.71 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.18 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.43 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.85 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.37 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  37.44 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  30.92 
 
 		 223 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 223 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.7 
 
 		 217 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.1 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.55 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  30.77 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.09 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.09 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  36.97 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  29.13 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  29.27 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.62 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.07 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  30.88 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.48 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.65 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  31.28 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  31.66 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0832  partition protein A  28.57 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.65 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.65 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.65 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.22 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  28.64 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  31.68 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.22 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.22 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.22 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.88 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  31.13 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  31.13 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.59 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  27.6 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  33.13 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  34.13 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  30.5 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 207 aa  62  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  26.89 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.87 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  29.22 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.62 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.69 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.57 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>