More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2179 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  64.93 
 
 		 210 aa  274  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 218 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 216 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  60.83 
 
 		 216 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  43.81 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 244 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  36.27 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 247 aa  104  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 247 aa  104  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  30.69 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 198 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.77 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.26 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.18 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  31.52 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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