52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2157 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.81 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.43 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.62 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  36.75 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  36.46 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  32.59 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  35.85 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  27.34 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  26.62 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  31.78 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  28.37 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 		 193 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.32 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  25.74 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  38.81 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  24.09 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  24.09 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  30.83 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  32.08 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  30.86 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  24.44 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.76 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  35.9 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  32.11 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  23.7 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  27.68 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  32.14 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  23.02 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  24.49 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  24.8 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  28.24 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 144 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  31.4 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  30.23 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 		 112 aa  40  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  36.76 
 
 		 150 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 144 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>