135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2088 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  68.67 
 
 		 166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  69.43 
 
 		 166 aa  230  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  67.9 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 		 169 aa  227  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  67.9 
 
 		 166 aa  225  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  65.03 
 
 		 169 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  61.78 
 
 		 167 aa  201  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  49.02 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  54.78 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  36.18 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  34.21 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  33.78 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  32.43 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  32.43 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  35.33 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  28.19 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  28.86 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  27.52 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  26.97 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  30.87 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  36.55 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  26.97 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  36.55 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  36.55 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  36.05 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  26.85 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  31.51 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  31.21 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  30.33 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  30.67 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  27.15 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2290  hypothetical protein  31.87 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  29.56 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  24.22 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  29.56 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  24.22 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2661  acetyltransferase  31.03 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.037655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  31.01 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  28.93 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29921  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.777494 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  28.89 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4454  GNAT family acetyltransferase  31.34 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  28.45 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  31.91 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6226  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0286732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0006  hypothetical protein  28.02 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1122  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.833574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6702  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51560  acetyltransferase  29.55 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.44093e-17  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0651  acetyltransferase  30.3 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1949  acetyltransferase  25.74 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1679  acetyltransferase  25.74 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00221151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  39.62 
 
 		 329 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>