More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2050 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  100 
 
 
592 aa  1206  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.38 
 
 
634 aa  360  3e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35 
 
 
678 aa  357  4e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.34 
 
 
619 aa  353  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1299  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.82 
 
 
613 aa  346  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294849  normal  0.177591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.6 
 
 
625 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.95 
 
 
619 aa  339  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.16 
 
 
628 aa  336  6e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6999  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.33 
 
 
609 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655968  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4250  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.56 
 
 
619 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.41 
 
 
664 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3068  asparagine synthase  40.99 
 
 
611 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.06 
 
 
660 aa  330  5e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.23 
 
 
660 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  36 
 
 
643 aa  327  4e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.32 
 
 
631 aa  326  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.25 
 
 
613 aa  326  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.33 
 
 
647 aa  324  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1627  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.26 
 
 
615 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0690  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.44 
 
 
615 aa  322  1e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0140  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.35 
 
 
614 aa  322  2e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0103295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37560  asparagine synthetase, glutamine-hydrolysing  37.56 
 
 
610 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.761947  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.68 
 
 
643 aa  319  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0872  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.31 
 
 
618 aa  316  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0025755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1505  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.19 
 
 
615 aa  316  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1034  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.35 
 
 
614 aa  315  1e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.59 
 
 
645 aa  315  2e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.31 
 
 
641 aa  314  3e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4134  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.72 
 
 
615 aa  313  4e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0371277  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2812  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.08 
 
 
614 aa  313  5e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.26 
 
 
626 aa  313  5e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1407  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.11 
 
 
607 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.508738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  34.99 
 
 
589 aa  310  3e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1310  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.72 
 
 
615 aa  311  3e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000179862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  34.99 
 
 
589 aa  310  3e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1207  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.56 
 
 
615 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0454357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1259  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.88 
 
 
615 aa  310  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.76 
 
 
666 aa  310  6e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.07 
 
 
635 aa  310  6e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4169  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.88 
 
 
619 aa  310  7e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.952215  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1234  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.56 
 
 
615 aa  309  1e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  34.83 
 
 
589 aa  308  2e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.26 
 
 
637 aa  308  2e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.43 
 
 
678 aa  308  2e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.6 
 
 
639 aa  308  2e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1586  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  36.36 
 
 
607 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.66408e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1625  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  36.02 
 
 
607 aa  306  5e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.462757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1751  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  36.02 
 
 
607 aa  306  5e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00305862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1056  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.46 
 
 
615 aa  306  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00820403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3575  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.96 
 
 
607 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.03 
 
 
613 aa  305  1e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.17 
 
 
607 aa  305  1e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  34.89 
 
 
589 aa  305  1e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.79 
 
 
591 aa  305  1e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.45 
 
 
600 aa  305  2e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.44 
 
 
603 aa  305  2e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00640  potential phenazine-modifying enzyme  34.95 
 
 
610 aa  304  3e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2683  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.67 
 
 
611 aa  304  3e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.890535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3071  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.64 
 
 
612 aa  303  6e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.19 
 
 
617 aa  303  6e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1577  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.75 
 
 
607 aa  303  6e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.702633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.51 
 
 
655 aa  303  7e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.84 
 
 
629 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1625  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.14 
 
 
607 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.786929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  35.88 
 
 
590 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.63 
 
 
625 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1055  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.77 
 
 
592 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1157  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.77 
 
 
592 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1074  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.77 
 
 
592 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1053  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.77 
 
 
592 aa  301  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1767  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  36.31 
 
 
607 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.75 
 
 
646 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.71 
 
 
611 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.76 
 
 
629 aa  299  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  34.58 
 
 
632 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.62 
 
 
593 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0232  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.43 
 
 
622 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1828  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.48 
 
 
607 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.433581  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  34.38 
 
 
632 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.78 
 
 
598 aa  296  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  33.28 
 
 
626 aa  296  7e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.36 
 
 
595 aa  296  9e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2121  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.5 
 
 
653 aa  296  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.973734  normal  0.744167 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  34.79 
 
 
592 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.66 
 
 
615 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0936  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.43 
 
 
622 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2198  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.43 
 
 
622 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.609185  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1222  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.43 
 
 
622 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.848255  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1921  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.43 
 
 
622 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1682  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.43 
 
 
622 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0231  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.43 
 
 
622 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166027  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0321  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.43 
 
 
622 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.07 
 
 
610 aa  293  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.38 
 
 
611 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.27 
 
 
594 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.67 
 
 
629 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.27 
 
 
590 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.54 
 
 
678 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.97 
 
 
633 aa  290  5e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.21 
 
 
666 aa  290  5e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>