More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2022 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
386 aa  787  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.98 
 
 
383 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.72 
 
 
383 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.08 
 
 
383 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.74 
 
 
392 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.34 
 
 
395 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  48.04 
 
 
377 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  48.48 
 
 
390 aa  353  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.86232e-09  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  48.72 
 
 
390 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.58 
 
 
392 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  46.94 
 
 
391 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  47.26 
 
 
390 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  49.12 
 
 
391 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  47.88 
 
 
377 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.67 
 
 
387 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  47.49 
 
 
387 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.38 
 
 
390 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.74 
 
 
390 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.67 
 
 
393 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.03 
 
 
390 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.76 
 
 
393 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.76 
 
 
393 aa  332  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  3.25534e-06 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.53 
 
 
393 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  46.72 
 
 
390 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  46.72 
 
 
390 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45 
 
 
392 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  44.88 
 
 
393 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  46.88 
 
 
396 aa  327  2e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.31 
 
 
395 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.38 
 
 
375 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  43.56 
 
 
423 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.27 
 
 
390 aa  322  7e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45 
 
 
399 aa  322  9e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24873e-07 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.16 
 
 
386 aa  321  1e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.01 
 
 
386 aa  320  2e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.57 
 
 
398 aa  320  4e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.71 
 
 
386 aa  320  4e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.57 
 
 
390 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  43.42 
 
 
389 aa  317  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  44.64 
 
 
409 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.88 
 
 
387 aa  312  7e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.75 
 
 
399 aa  309  6e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.72 
 
 
377 aa  308  1e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  44.47 
 
 
381 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.26 
 
 
396 aa  304  1e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.99 
 
 
390 aa  303  3e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.99 
 
 
403 aa  303  5e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1141  rhodanese-like  45.07 
 
 
381 aa  303  5e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.83 
 
 
266 aa  302  6e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  45.83 
 
 
378 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.78 
 
 
379 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20318  predicted protein  42.79 
 
 
460 aa  298  9e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  42.2 
 
 
388 aa  296  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  43.16 
 
 
379 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  42.22 
 
 
368 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.49 
 
 
392 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  42.22 
 
 
368 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.52 
 
 
400 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.52 
 
 
400 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.52 
 
 
400 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.97 
 
 
407 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.49 
 
 
392 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.42 
 
 
397 aa  289  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.08 
 
 
361 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.26 
 
 
348 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.65 
 
 
389 aa  283  4e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.1 
 
 
266 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.44 
 
 
270 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.10136e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.25 
 
 
273 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  41.71 
 
 
345 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.02 
 
 
270 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.38 
 
 
270 aa  275  1e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  52.21 
 
 
271 aa  275  1e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.74 
 
 
280 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.59 
 
 
380 aa  273  4e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.79 
 
 
287 aa  272  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.2 
 
 
271 aa  272  9e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  50 
 
 
269 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  57.02 
 
 
480 aa  270  3e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.58 
 
 
268 aa  270  3e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49 
 
 
270 aa  270  3e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.8 
 
 
272 aa  269  6e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  50 
 
 
264 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.98 
 
 
367 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.23 
 
 
270 aa  266  3e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.37 
 
 
388 aa  263  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.33 
 
 
278 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  39.2 
 
 
381 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.2 
 
 
269 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.4844e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.32 
 
 
364 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.4 
 
 
355 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17761  molybdopterin biosynthesis protein  39.1 
 
 
381 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1907  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.94 
 
 
364 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107566  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.03 
 
 
260 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  47.37 
 
 
248 aa  255  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.93391e-11  hitchhiker  5.36113e-07 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1661  rhodanese-like protein  39.74 
 
 
380 aa  254  1e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.97 
 
 
260 aa  254  1e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.28 
 
 
347 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.4 
 
 
255 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  37.53 
 
 
382 aa  253  5e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>