More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2018 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 488 aa  980    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  72.09 
 
 		 484 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2515  histidine kinase  34.81 
 
 		 450 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 447 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  29.82 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 465 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.32 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  31.2 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 459 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 457 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  33.85 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  35.46 
 
 		 1093 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.05 
 
 		 526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344841  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  29.21 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  33.66 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  33.59 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  33.73 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  33.33 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  27.9 
 
 		 608 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  28.5 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 455 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  29.34 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  32.81 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 455 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  35.47 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3932  histidine kinase  32.93 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  33.1 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  34.15 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248447  normal  0.139653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3588  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.08 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.08 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  34.58 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  32.77 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 515 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547854 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 488 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 430 aa  104  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  33.47 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 490 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  28.85 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 440 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  30.53 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.82 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>