More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2013 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  919    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  68.52 
 
 		 466 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  49.9 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  49.27 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.42 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  47.91 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  46.84 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.84 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  39.87 
 
 		 454 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  41.11 
 
 		 601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  43.08 
 
 		 613 aa  189  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  42.69 
 
 		 615 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  43.77 
 
 		 599 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.4 
 
 		 598 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  41.9 
 
 		 598 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  41.89 
 
 		 610 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  30.53 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  32.3 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.44 
 
 		 421 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  27.21 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  29.65 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.47 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  30.04 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.14 
 
 		 435 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  29.6 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  29.02 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.51 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  30.77 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  28.75 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  26.51 
 
 		 418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  28.69 
 
 		 410 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  28.77 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  29.35 
 
 		 430 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  28.66 
 
 		 396 aa  127  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  28.54 
 
 		 399 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  30.06 
 
 		 440 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  28.66 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  29.3 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  30.08 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  29.01 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  29.29 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  28.9 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  28.69 
 
 		 413 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  27.24 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  28.51 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  27.97 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  28.48 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  29.96 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  25.89 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  29.17 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  28.33 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  28.33 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  26.32 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.64 
 
 		 462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  28.45 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  28.45 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  28.45 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  28.48 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  29.89 
 
 		 415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.54 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  27.27 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  26.07 
 
 		 519 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  26.97 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  28.4 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  29.68 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.32 
 
 		 413 aa  117  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  28.66 
 
 		 410 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  46.67 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  26.62 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  27.25 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  26.68 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  27.66 
 
 		 395 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  27.33 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  27.97 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.96 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.29 
 
 		 499 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  27.99 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  25.84 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  27.31 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  25.6 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  26.51 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  25.79 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  23.59 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  27.23 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  25.64 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  28.11 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  27.46 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4674  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  26.92 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  28.87 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.46 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  27.6 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  25.26 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  29.47 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>