More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1999 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1999  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
268 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5048  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.22 
 
 
253 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.986689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1025  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.64 
 
 
253 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.49 
 
 
258 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  normal  0.315774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
267 aa  331  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.02 
 
 
256 aa  329  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.87 
 
 
257 aa  323  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0201  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.48 
 
 
261 aa  323  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19793  normal  0.222438 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
254 aa  319  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2916  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.98 
 
 
252 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.84 
 
 
252 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.614437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6100  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.2 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2379  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.81 
 
 
258 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.272074  hitchhiker  0.0000354312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0866  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.8 
 
 
262 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.96 
 
 
273 aa  308  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2694  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.2 
 
 
252 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1698  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.92 
 
 
253 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.891698  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1403  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.13 
 
 
253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2297  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.13 
 
 
253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1486  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.13 
 
 
253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0520  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.13 
 
 
253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.62164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1065  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.13 
 
 
253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0128  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.13 
 
 
253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0982  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.13 
 
 
253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2975  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.2 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.065434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3687  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.17 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101033  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.47 
 
 
269 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0050  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.47 
 
 
257 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0341246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0355  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.94 
 
 
257 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654487  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.35 
 
 
260 aa  298  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0184515  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5744  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.38 
 
 
259 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6912  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.72 
 
 
260 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.6 
 
 
258 aa  288  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2653  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  52.9 
 
 
275 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.2 
 
 
259 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5417  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.73 
 
 
266 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3497  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.73 
 
 
266 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.393311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4869  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.73 
 
 
266 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.4 
 
 
260 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0762  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.98 
 
 
255 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3029  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  58.17 
 
 
258 aa  279  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0628  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.2 
 
 
259 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.22 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0978  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.16 
 
 
261 aa  264  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
259 aa  261  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  46 
 
 
255 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.6 
 
 
256 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.21 
 
 
273 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  45.82 
 
 
254 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.69 
 
 
272 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.82 
 
 
272 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.01 
 
 
273 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  43.43 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  43.82 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.22 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.01 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.41 
 
 
272 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
254 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.62 
 
 
292 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.01 
 
 
272 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  46.54 
 
 
286 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45 
 
 
272 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
282 aa  232  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
282 aa  231  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
254 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3284  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.69 
 
 
264 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
258 aa  230  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.64 
 
 
256 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0465054  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
272 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1377  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0829066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1139  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000599586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1119  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1113  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000710304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
256 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1232  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1300  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000387005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1272  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00654977  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.42 
 
 
268 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1339  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4070  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.25 
 
 
256 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.100281  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
273 aa  229  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.31 
 
 
282 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3279  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.59 
 
 
256 aa  228  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.42 
 
 
279 aa  228  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
258 aa  228  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2558  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  44.44 
 
 
256 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.646059  hitchhiker  0.0000154465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0920  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.31 
 
 
258 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000398109  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.61 
 
 
272 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0307  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  44.22 
 
 
254 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00919457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4281  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.08 
 
 
258 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.02 
 
 
272 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
261 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.76 
 
 
282 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0373  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.14 
 
 
258 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
265 aa  224  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4769  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  44.22 
 
 
267 aa  224  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0134326  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.82 
 
 
274 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.82 
 
 
274 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>