More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1962 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  68.25 
 
 		 218 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  66.35 
 
 		 214 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  55.67 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  55.61 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  51.42 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  50.94 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  47.44 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  51.17 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  52.56 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  51.16 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  47.95 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  45.79 
 
 		 242 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  51.16 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.89 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  50.76 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 254 aa  181  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 		 284 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1349  ABC transporter related  43.66 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  hitchhiker  0.0000183126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.79 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 398 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.79 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 		 271 aa  167  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.19 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  41.98 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 440 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.65 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  43.6 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.76 
 
 		 244 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  38.97 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.02 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.24 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  44.33 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  39.01 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.04 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 456 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.65 
 
 		 277 aa  158  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 453 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 403 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  42.38 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  38.97 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 403 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.28 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  42.33 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.27 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 395 aa  154  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.17 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  41.59 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  41.59 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.13 
 
 		 256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.71 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  41.59 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  40 
 
 		 380 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.28 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 		 402 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0174  cobalt transport ATP-binding protein CbiO  40.41 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 270 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  35.81 
 
 		 283 aa  151  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  38.18 
 
 		 288 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.51 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  38.39 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.95 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0554  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  37.63 
 
 		 216 aa  149  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.7 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  38.12 
 
 		 810 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.82 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  46.5 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.16 
 
 		 286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  38.77 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.05 
 
 		 277 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  42.51 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  45.36 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 411 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  38.39 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  37.07 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.99 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.306456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>