More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1911 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1911  ATPase  100 
 
 		 356 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.75 
 
 		 345 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.97 
 
 		 343 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  66.97 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.97 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.97 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  65.77 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  60.36 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  59.94 
 
 		 340 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  60.24 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  58.28 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  57.36 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.16 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  58.65 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  59.16 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  60.06 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  57.06 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  56.16 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  57.58 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  54.95 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  37.13 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  33.63 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.9 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  37.8 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  37.13 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  39.21 
 
 		 348 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  37.13 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  33.54 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  37.87 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  33.23 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  35.06 
 
 		 331 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  35.86 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  33.78 
 
 		 327 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  35.76 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  36.04 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  36.57 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  35.92 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  35.87 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  37.66 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  34.16 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  34.16 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  35.6 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1989  Von Willebrand factor type A domain containing membrane protein  34.95 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  35.6 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  34.57 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  33.78 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.19 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  36.25 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  33.64 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  35.28 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.82 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  32.83 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  33.99 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  35.28 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  34.95 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  35.28 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  33.89 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  35.33 
 
 		 371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.44 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.59 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  32.58 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.5 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  34.42 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.7 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  32.82 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  29.94 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  35.37 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.12 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  33.88 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  34 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  34.45 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  30.63 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.55 
 
 		 353 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.66 
 
 		 319 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.15 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.24 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  35.08 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.05 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  31.89 
 
 		 331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  33.63 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  35.35 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  35.14 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  33.05 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  35.02 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  35.02 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  33.65 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  34.04 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  35.02 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  35.37 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  35.14 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  34.41 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  34.43 
 
 		 324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  35.37 
 
 		 333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  28.7 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  34.66 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.23 
 
 		 333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  34.8 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  35.14 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  34.9 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>