96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1805 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  78.29 
 
 		 417 aa  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  77.13 
 
 		 431 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 416 aa  839    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  76.59 
 
 		 417 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  76.98 
 
 		 417 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  75.85 
 
 		 418 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  60.38 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  59.52 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  61.52 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  62.44 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  61.39 
 
 		 420 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  64.02 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  58.05 
 
 		 430 aa  484  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  61.52 
 
 		 421 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  55.87 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  54.45 
 
 		 403 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  45.61 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  49.11 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  45.43 
 
 		 407 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  45.69 
 
 		 406 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  44.47 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  41.5 
 
 		 398 aa  309  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  45.69 
 
 		 405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  42.68 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  45.99 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  43.07 
 
 		 401 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  43.31 
 
 		 401 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  43.31 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  45.79 
 
 		 388 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  42.63 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  40.93 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  49.22 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  49.22 
 
 		 398 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  43.19 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  44.51 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  42.55 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  35.12 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  34.79 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  36.02 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  31.84 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  35.01 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  36.97 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  36.67 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  30.61 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  34.45 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  34.12 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  32.72 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  33.51 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  33.51 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  33.5 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  33.5 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  31.68 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  30.9 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  31.36 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  34.16 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  33.61 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  32.18 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  31.39 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  29.9 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  33.75 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  33.03 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  32.58 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  34.11 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.74 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  32.11 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  26.88 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  26.72 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  28.57 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  26.75 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  24.92 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25.72 
 
 		 394 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  28.14 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  26.54 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  24.11 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  26.19 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  26.73 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  27.89 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  24.93 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  25.49 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  25.71 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  21.07 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  21.07 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  21.07 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  24.68 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  22.22 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  22.22 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.68 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.4 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  23.93 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  21.15 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  26.09 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  23.65 
 
 		 483 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  25.36 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  24.48 
 
 		 279 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  23.84 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  24.35 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>