87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1804 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 		 220 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  72.17 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  67.42 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  68.47 
 
 		 240 aa  278  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  77.16 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  67.28 
 
 		 215 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  56.85 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  57.94 
 
 		 159 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  54.68 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  53.68 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  53.68 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  49.29 
 
 		 177 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  49.29 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  60.61 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  50 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  60.61 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  57.14 
 
 		 184 aa  144  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  52.87 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  46.2 
 
 		 190 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  46.67 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  59.85 
 
 		 157 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  52.35 
 
 		 144 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  53.52 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  53.52 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  53.85 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  37.93 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  46.48 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  38.19 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  48.72 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  45.83 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  46.04 
 
 		 371 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  38.16 
 
 		 177 aa  118  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  47.79 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  42.76 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  44.12 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  42.77 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  36.32 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  36.18 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  40.29 
 
 		 172 aa  102  5e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  41.78 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  41.1 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  39.39 
 
 		 236 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  40.67 
 
 		 186 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  33.78 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  39.02 
 
 		 250 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  39.57 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  37.58 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  35.17 
 
 		 165 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  40.14 
 
 		 165 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  38.67 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  44.03 
 
 		 149 aa  85.9  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  35.22 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  39.13 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  32.24 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  40.43 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  32.17 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  34.04 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  34.04 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  32.39 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  32.86 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  33.93 
 
 		 579 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  22.5 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  29.12 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  28.57 
 
 		 506 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  32.31 
 
 		 169 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  27.67 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  36.04 
 
 		 646 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  31.21 
 
 		 526 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  29.2 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  29.2 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  31.21 
 
 		 526 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  31.3 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  31.21 
 
 		 526 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  28.48 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  33.09 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  27.27 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  32.53 
 
 		 420 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  27.92 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  27.4 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  26.36 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  27.4 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  27.4 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  27.4 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  27.33 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  27.33 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  29.56 
 
 		 220 aa  42  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  29.56 
 
 		 220 aa  42  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>