224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1775 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1775  chromosomal replication initiator, DnaA-like  100 
 
 		 131 aa  259  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141537  normal  0.0422167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  54.24 
 
 		 330 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0873  chromosomal replication initiator, DnaA-like  40.83 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0073  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  50.59 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0875  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  62.07 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0571  hypothetical protein  33.07 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0572  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2688  hypothetical protein  45.68 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1287  hypothetical protein  37.38 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0894  DnaA related protein  42.71 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0568885  normal  0.192838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.44 
 
 		 454 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.14 
 
 		 458 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50 
 
 		 652 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.53 
 
 		 528 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  37.36 
 
 		 426 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2470  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  42.35 
 
 		 451 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000450435  decreased coverage  0.000021733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  43.84 
 
 		 615 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.03 
 
 		 527 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 		 443 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.25 
 
 		 468 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0547  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 		 455 aa  50.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.83 
 
 		 534 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.75 
 
 		 476 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.83 
 
 		 490 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  47.14 
 
 		 582 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.23 
 
 		 444 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.62 
 
 		 447 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 		 453 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 		 500 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 		 453 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  37.21 
 
 		 456 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1203  hypothetical protein  35.87 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  35 
 
 		 441 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  36.56 
 
 		 482 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  35.96 
 
 		 454 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 460 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.91 
 
 		 490 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  36.26 
 
 		 510 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  43.06 
 
 		 524 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.24 
 
 		 570 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2081  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.71 
 
 		 444 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 		 557 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.44 
 
 		 539 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.48 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3048  Chromosomal replication initiator DnaA domain  35.9 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.48 
 
 		 489 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.94 
 
 		 509 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.19 
 
 		 453 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 		 470 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  42.42 
 
 		 507 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.78 
 
 		 480 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.12 
 
 		 469 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  36 
 
 		 481 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.5 
 
 		 454 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0001  chromosomal replication initiation protein  39.44 
 
 		 450 aa  45.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14003  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  48.21 
 
 		 498 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  42.25 
 
 		 460 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.08 
 
 		 450 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  36.26 
 
 		 463 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  34.04 
 
 		 454 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  36.26 
 
 		 466 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  35.53 
 
 		 452 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3182  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 525 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4462  chromosomal replication initiation protein  47.54 
 
 		 544 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369414  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  42.42 
 
 		 494 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3410  Chromosomal replication initiator DnaA domain protein  33.33 
 
 		 353 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.26 
 
 		 476 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  36.26 
 
 		 464 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.65 
 
 		 468 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.504592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.12 
 
 		 506 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  42.42 
 
 		 492 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.66 
 
 		 452 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.66 
 
 		 452 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0001  chromosomal replication initiation protein  47.54 
 
 		 545 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.54 
 
 		 460 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3239  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 536 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 524 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  38.46 
 
 		 464 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  38.37 
 
 		 481 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  0.0000132312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.06 
 
 		 476 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.84 
 
 		 458 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0001  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 525 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.54964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.84 
 
 		 457 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0001  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 525 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470928  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0001  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 525 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.375862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0001  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 525 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.84 
 
 		 458 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.642336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.98 
 
 		 566 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0001  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 518 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.54 
 
 		 587 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  37.36 
 
 		 464 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  39.39 
 
 		 495 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  39.39 
 
 		 495 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  39.39 
 
 		 495 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  60 
 
 		 524 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  60 
 
 		 516 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 		 439 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2553  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 		 561 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.18 
 
 		 453 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  37.21 
 
 		 479 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>