14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1773 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1773  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185989  decreased coverage  0.00548408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1939  hypothetical protein  43.02 
 
 		 302 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0577581  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2056  hypothetical protein  43.64 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2628  hypothetical protein  40.41 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.460391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3520  hypothetical protein  41.29 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2228  hypothetical protein  34.22 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00178512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3041  hypothetical protein  35.95 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3320  hypothetical protein  62.79 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3299  hypothetical protein  29.43 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3622  hypothetical protein  29.45 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.453951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5904  hypothetical protein  42.86 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188041  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4496  hypothetical protein  46.51 
 
 		 282 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5306  hypothetical protein  45.83 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1675  hypothetical protein  43.75 
 
 		 333 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>