120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1634 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  84.5 
 
 
405 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  100 
 
 
400 aa  809    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  84.25 
 
 
414 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  78.7 
 
 
401 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  82.62 
 
 
405 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  79.11 
 
 
410 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  71.61 
 
 
408 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  54.1 
 
 
418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  55.21 
 
 
395 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  54.45 
 
 
394 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  54.01 
 
 
429 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  49.62 
 
 
403 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  49.87 
 
 
407 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  51.05 
 
 
403 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  47.61 
 
 
427 aa  332  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  48.22 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  47.97 
 
 
398 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  47.45 
 
 
398 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  45.2 
 
 
420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  44.05 
 
 
419 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  46.83 
 
 
459 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  47.41 
 
 
421 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  46.83 
 
 
460 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  41.78 
 
 
404 aa  289  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  44.62 
 
 
409 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  42.78 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  42.51 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  43.58 
 
 
428 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  44.53 
 
 
411 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  45.19 
 
 
393 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  41.05 
 
 
410 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  39.59 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  39.74 
 
 
389 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  39.53 
 
 
405 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  39.11 
 
 
407 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  37.3 
 
 
380 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  38.56 
 
 
404 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  35.16 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  38.28 
 
 
394 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  37.08 
 
 
424 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  38.42 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  37.37 
 
 
375 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  37.06 
 
 
379 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  37 
 
 
364 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  35.57 
 
 
404 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  33.06 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  39.85 
 
 
371 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  38.35 
 
 
370 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  32.89 
 
 
379 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  32.03 
 
 
415 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  31.19 
 
 
389 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  33.16 
 
 
398 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  32.28 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  37.5 
 
 
385 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  37.94 
 
 
419 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  32.43 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  27.76 
 
 
393 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  30.33 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  29.19 
 
 
377 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  30.16 
 
 
364 aa  116  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  27.86 
 
 
401 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.97 
 
 
400 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  28.78 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  29.97 
 
 
372 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  25.79 
 
 
401 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  27.54 
 
 
422 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  27.54 
 
 
422 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  27.32 
 
 
422 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  31.8 
 
 
403 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  27.11 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  23.96 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  29.49 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  23.96 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  27.14 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  29 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  28.57 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  30.62 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  29.9 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  25.68 
 
 
462 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  24.51 
 
 
492 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  31.22 
 
 
466 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  27.78 
 
 
455 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  26.1 
 
 
462 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  24.1 
 
 
460 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  22.89 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  26.34 
 
 
445 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  28.91 
 
 
484 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  22.62 
 
 
447 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  24.7 
 
 
456 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  28.78 
 
 
475 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  25.85 
 
 
482 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  35.54 
 
 
469 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  27.98 
 
 
492 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  25.45 
 
 
480 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  25.45 
 
 
480 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  25.45 
 
 
480 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  27.64 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3559  hypothetical protein  22.99 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306765  normal  0.452046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  27.64 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2882  hypothetical protein  22.99 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>