261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1599 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 123 aa  254  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  90.09 
 
 		 113 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1760  glutaredoxin-like protein  88.39 
 
 		 127 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.608629  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  88.18 
 
 		 112 aa  207  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3704  glutaredoxin-like protein  83.93 
 
 		 127 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1796  glutaredoxin-like protein  87.04 
 
 		 108 aa  199  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  84.55 
 
 		 112 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  80.56 
 
 		 111 aa  183  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  77.78 
 
 		 111 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  75 
 
 		 111 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  76.85 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  75.93 
 
 		 111 aa  177  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  74.07 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  71.17 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2391  glutaredoxin-like protein  73.64 
 
 		 110 aa  173  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0827  glutaredoxin-related protein  71.43 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0835  glutaredoxin-related protein  71.43 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  72.73 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0012  glutaredoxin-like protein  71.15 
 
 		 111 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0865  glutaredoxin-like protein  66.36 
 
 		 110 aa  164  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0014  glutaredoxin-like protein  69.23 
 
 		 111 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.900956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0013  glutaredoxin-like protein  69.23 
 
 		 111 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  68.27 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1186  glutaredoxin-like protein  68.18 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0187  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381703  normal  0.468757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2584  glutaredoxin-like protein  68.93 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442279  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  66.06 
 
 		 109 aa  151  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 		 113 aa  150  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  63.3 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  70.41 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 		 110 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  62.26 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1021  glutaredoxin-like protein  62.75 
 
 		 110 aa  144  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681267  normal  0.445361 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  60.4 
 
 		 110 aa  141  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1598  glutaredoxin-like protein  58.72 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2953  glutaredoxin-related protein  58.72 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0892  glutaredoxin-like protein  58.72 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  63.64 
 
 		 99 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  62.63 
 
 		 99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  60.78 
 
 		 113 aa  136  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0491  glutaredoxin-related protein  58.65 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249105  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0701  glutaredoxin-like protein  58.16 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  60.61 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  59.05 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  61.9 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  64.36 
 
 		 103 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1116  glutaredoxin-like protein  56.73 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  62.14 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2171  glutaredoxin-like protein  53.64 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  63.37 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  65.31 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  63.37 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  62.38 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  63 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  62.38 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  63.37 
 
 		 103 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  63.37 
 
 		 103 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  62.38 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  61.39 
 
 		 103 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  63.37 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  63.37 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  63.37 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  63.37 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  63.37 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  63.37 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  63.37 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  63 
 
 		 110 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  59.8 
 
 		 308 aa  130  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  62.38 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  63.37 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0203  glutaredoxin-related protein  62.11 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00589831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  56.86 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  59.46 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  67.02 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  55.77 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  59.18 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1392  glutaredoxin-like protein  55.66 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394027  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04720  conserved hypothetical protein  58.65 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.81945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  60.78 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  60.22 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  58.42 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48859  predicted protein  61 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.815373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  58.42 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  54 
 
 		 110 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04304  glutaredoxin (Eurofung)  58.65 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.951859  normal  0.209179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  61.22 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  56.99 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  59 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  57 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  55.91 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37615  glutaredoxin  53.06 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  56 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>