191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1445 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  100 
 
 
266 aa  550  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  85.34 
 
 
270 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  85.71 
 
 
265 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  84.21 
 
 
265 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  80.83 
 
 
265 aa  453  1e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  81.2 
 
 
278 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  79.92 
 
 
270 aa  444  1e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  70.45 
 
 
269 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  66.8 
 
 
280 aa  357  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  66.27 
 
 
265 aa  355  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  65.06 
 
 
301 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  65.89 
 
 
280 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  66.67 
 
 
270 aa  351  6e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  67.21 
 
 
270 aa  348  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  67.62 
 
 
270 aa  348  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  67.21 
 
 
270 aa  347  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  63.92 
 
 
288 aa  345  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  63.12 
 
 
286 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  65.18 
 
 
272 aa  343  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  61.99 
 
 
290 aa  341  6e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  66.39 
 
 
277 aa  337  1e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  68.05 
 
 
273 aa  334  8e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  60.08 
 
 
286 aa  327  1e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  58.65 
 
 
276 aa  322  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  57.85 
 
 
289 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  61.13 
 
 
315 aa  320  2e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1122  metallophosphoesterase  57.69 
 
 
296 aa  320  2e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1203  metallophosphoesterase  59.04 
 
 
296 aa  319  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.652482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  62.92 
 
 
322 aa  319  4e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  60.66 
 
 
310 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1911  metallophosphoesterase  57.85 
 
 
316 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.982767  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2234  metallophosphoesterase  57.85 
 
 
316 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  56.23 
 
 
309 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  59.67 
 
 
325 aa  306  2e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  56.85 
 
 
314 aa  303  2e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0905  metallophosphoesterase  55 
 
 
309 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  57.2 
 
 
332 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0018  metallophosphoesterase  55.56 
 
 
283 aa  295  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.511643  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  52.65 
 
 
313 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  52.65 
 
 
313 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  54.05 
 
 
268 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  54.23 
 
 
267 aa  291  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  52.47 
 
 
312 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  52.47 
 
 
330 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1008  metallophosphoesterase  54.32 
 
 
312 aa  291  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0140335  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  53.08 
 
 
312 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  53.08 
 
 
312 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  53.08 
 
 
312 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  50.95 
 
 
312 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  55 
 
 
355 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0637  metallophosphoesterase  54 
 
 
290 aa  290  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0426025  normal  0.0997197 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.15 
 
 
312 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  51.15 
 
 
312 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.15 
 
 
312 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.15 
 
 
312 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.15 
 
 
312 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.15 
 
 
312 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.15 
 
 
312 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1735  metallophosphoesterase  53.61 
 
 
303 aa  288  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0014324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  55.14 
 
 
268 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2027  metallophosphoesterase  53.66 
 
 
315 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0129825  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  52.9 
 
 
270 aa  283  3e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.69 
 
 
273 aa  281  6e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  50 
 
 
273 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  55.46 
 
 
270 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  55.04 
 
 
273 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  53.97 
 
 
280 aa  275  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  50.77 
 
 
265 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1401  metallophosphoesterase  50.38 
 
 
265 aa  272  5e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159972  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4016  metallophosphoesterase  53.28 
 
 
270 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  53.28 
 
 
274 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1475  metallophosphoesterase  50.77 
 
 
271 aa  269  3e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  53.28 
 
 
270 aa  270  3e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.65478e-09 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  47.77 
 
 
279 aa  267  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2925  metallophosphoesterase  52.87 
 
 
275 aa  261  7e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1802  metallophosphoesterase  53.78 
 
 
284 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  47.98 
 
 
255 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  49.6 
 
 
275 aa  248  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  50 
 
 
273 aa  244  2e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  50 
 
 
273 aa  244  2e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  45.61 
 
 
289 aa  239  3e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  48.18 
 
 
275 aa  233  2e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  46.96 
 
 
283 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02091  metallophosphoesterase  42.02 
 
 
265 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  42.13 
 
 
267 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  40.96 
 
 
286 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  9.78439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  42.74 
 
 
300 aa  221  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0044  metallophosphoesterase  47.27 
 
 
363 aa  221  1e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  41.53 
 
 
272 aa  216  3e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3813  calcineurin-like phosphoesterase  41.49 
 
 
298 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  44.12 
 
 
655 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3025  metallophosphoesterase  41.06 
 
 
293 aa  208  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0823  metallophosphoesterase  43.07 
 
 
268 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0992  hypothetical protein  42.5 
 
 
282 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1061  metallophosphoesterase  37.36 
 
 
357 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1122  metallophosphoesterase  36.98 
 
 
360 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  37.36 
 
 
360 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2538  metallophosphoesterase  44.03 
 
 
269 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1239  hypothetical protein  36.6 
 
 
352 aa  200  2e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3346  metallophosphoesterase  36.04 
 
 
374 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>