More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1409 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 317 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  91.17 
 
 		 317 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.96 
 
 		 317 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.01 
 
 		 317 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.12 
 
 		 317 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.44 
 
 		 317 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.8 
 
 		 331 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.23 
 
 		 317 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.57 
 
 		 310 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.39 
 
 		 310 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.21 
 
 		 314 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.39 
 
 		 310 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.71 
 
 		 316 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  76.43 
 
 		 346 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  76.36 
 
 		 314 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.1 
 
 		 314 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.14 
 
 		 311 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.42 
 
 		 310 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.1 
 
 		 314 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.1 
 
 		 310 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  76.77 
 
 		 310 aa  484  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.16 
 
 		 310 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.16 
 
 		 310 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  76.45 
 
 		 328 aa  482  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.52 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.87 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.31 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.9 
 
 		 310 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.31 
 
 		 311 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2438  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.67 
 
 		 311 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167005  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.71 
 
 		 310 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.74 
 
 		 310 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.42 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.13 
 
 		 310 aa  411  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.59 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.21 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  63.41 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.41 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.46 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  61.94 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.25 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.18 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.26 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.18 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.26 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.18 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.19 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.86 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.33 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.01 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.31 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.33 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.36 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.68 
 
 		 318 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.59 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 		 314 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.88 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  58.25 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.19 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.06 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.7 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.82 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 		 321 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.25 
 
 		 315 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.92 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 		 315 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.74 
 
 		 321 aa  351  8e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 		 317 aa  351  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.61 
 
 		 311 aa  350  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.29 
 
 		 324 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 		 321 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 		 321 aa  348  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 		 321 aa  348  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.61 
 
 		 314 aa  348  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 		 316 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.11 
 
 		 321 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 		 317 aa  346  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 		 317 aa  346  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 		 317 aa  346  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 		 317 aa  346  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>