More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1392 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  76.36 
 
 		 464 aa  706    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  80.82 
 
 		 476 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  100 
 
 		 489 aa  997    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  83.11 
 
 		 461 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  80.32 
 
 		 464 aa  725    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  74.45 
 
 		 461 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  81.09 
 
 		 463 aa  744    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  58.39 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  55.9 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  55.16 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  55.42 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  57.8 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  54.7 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  53.66 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  53.5 
 
 		 468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  53.98 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  53.98 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  51.12 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  51.12 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  48.83 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  51.61 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  48.23 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  47.2 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  46.35 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  46.52 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  46.67 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  45.1 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  43.88 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  48.43 
 
 		 472 aa  353  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  43.4 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  38.52 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  41.34 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  41.19 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  39.91 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  38.12 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  38.18 
 
 		 459 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  38.01 
 
 		 470 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  38.33 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  40.1 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  36.41 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  36.41 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  36.01 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  36.74 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  36.52 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  40.05 
 
 		 462 aa  266  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  34.54 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  34.73 
 
 		 493 aa  262  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  36.8 
 
 		 504 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  36.69 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  36.66 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  37.21 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  36.67 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  35.75 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  36.22 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  35.51 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  36.24 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  36.23 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  35.27 
 
 		 459 aa  255  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  35.99 
 
 		 494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  37.59 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  36.58 
 
 		 448 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  36.17 
 
 		 451 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  37.59 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  36.17 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  36.17 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  37.73 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  37.01 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  34.46 
 
 		 489 aa  249  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  35.53 
 
 		 484 aa  246  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  34.14 
 
 		 493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  34.78 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  34.78 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  35.01 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  36.43 
 
 		 479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  32.99 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  37.26 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  37.98 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  35.92 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  32.01 
 
 		 446 aa  229  8e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  34.31 
 
 		 455 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  33.1 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  33.26 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  35.19 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  35.52 
 
 		 457 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  31.08 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  31.08 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  36.38 
 
 		 458 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  35.98 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  36.08 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  35.48 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  33.57 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  34.71 
 
 		 415 aa  216  9e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  33.64 
 
 		 443 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  30.75 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  30.88 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  32.95 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  32.84 
 
 		 949 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  32.71 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  32.71 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.71 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>