More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1316 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1316  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  100 
 
 
312 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  93.91 
 
 
312 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  92.31 
 
 
312 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  95.83 
 
 
312 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469245  hitchhiker  0.00416412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6414  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  82.52 
 
 
301 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1845  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  78.52 
 
 
297 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  77.46 
 
 
297 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124271  normal  0.0880049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0620  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  80.07 
 
 
295 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000136812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5358  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  77.11 
 
 
297 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5280  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  77.46 
 
 
297 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3721  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.4 
 
 
301 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0606642 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05991  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.91 
 
 
295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05691  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.91 
 
 
295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0543  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.91 
 
 
295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06071  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.56 
 
 
295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.817258  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.83 
 
 
299 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.91 
 
 
297 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0741  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  75.43 
 
 
296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.91 
 
 
297 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1872  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.96 
 
 
296 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05971  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.96 
 
 
296 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.848004  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.13 
 
 
297 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2039  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  75.58 
 
 
302 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1621  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.04 
 
 
299 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05451  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.2 
 
 
296 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.240538  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.01 
 
 
296 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0158  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  71.33 
 
 
319 aa  431  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1634  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.79 
 
 
301 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.948044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  56.3 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.94 
 
 
276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3478  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.65 
 
 
273 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.57 
 
 
275 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.85 
 
 
273 aa  278  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.48 
 
 
275 aa  278  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.4 
 
 
276 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  50.93 
 
 
275 aa  275  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  50.93 
 
 
275 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.1 
 
 
275 aa  271  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1532  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  55.68 
 
 
288 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.185742  normal  0.0569964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1419  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.68 
 
 
286 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3939  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  55.64 
 
 
286 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2332  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.51 
 
 
307 aa  257  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0791  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.17 
 
 
289 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2375  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.17 
 
 
304 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0819  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.17 
 
 
289 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.147693  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2306  light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.79 
 
 
288 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  41.35 
 
 
292 aa  192  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.45 
 
 
268 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  41.67 
 
 
290 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  42.48 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  40.82 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  40.52 
 
 
299 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  37.72 
 
 
292 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  38.43 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  36.43 
 
 
292 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  39.85 
 
 
280 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  38.38 
 
 
292 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  39.92 
 
 
270 aa  176  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  39.18 
 
 
289 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  38.03 
 
 
313 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  42.36 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  38.81 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.53 
 
 
265 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  41.2 
 
 
731 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.7 
 
 
296 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  42.86 
 
 
272 aa  169  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.9 
 
 
287 aa  168  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  40.79 
 
 
293 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  35.56 
 
 
264 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  38.11 
 
 
278 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  38.4 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  38.31 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  38.31 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  37.2 
 
 
289 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  34.91 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  38.4 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  37.61 
 
 
297 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  35.74 
 
 
299 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  36.3 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  38.33 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  35.04 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  34.64 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  38.49 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  39.56 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  39.11 
 
 
298 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  44.18 
 
 
259 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  37.61 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.55 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.46 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  39.04 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  38 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  38.01 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  35.83 
 
 
299 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.89 
 
 
324 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  35.07 
 
 
290 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  37.31 
 
 
273 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  35.66 
 
 
276 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  34.91 
 
 
295 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  38.67 
 
 
298 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  34.91 
 
 
295 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>