26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1244 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  309  7e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  1.77159e-08 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  69.13 
 
 
149 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  65.33 
 
 
154 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  67.57 
 
 
150 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  79  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  32.61 
 
 
158 aa  77.4  6e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  35.16 
 
 
153 aa  76.6  1e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  35.16 
 
 
153 aa  76.6  1e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  73.6  1e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  28.79 
 
 
148 aa  72  3e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  28.79 
 
 
148 aa  72  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3562  hypothetical protein  31.62 
 
 
147 aa  63.5  1e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  31.62 
 
 
151 aa  56.6  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  29.75 
 
 
150 aa  52.4  2e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  26.77 
 
 
166 aa  51.6  4e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  29.55 
 
 
148 aa  49.3  2e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  26.43 
 
 
151 aa  49.7  2e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  26.27 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  25.38 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  28.36 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  23.24 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  25.19 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  27.78 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  31.78 
 
 
1088 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  27.68 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>