18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1242 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  172  2e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  1.75361e-08 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  64.63 
 
 
218 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  2.32118e-08 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  58.24 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  58.24 
 
 
96 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  55.91 
 
 
96 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  52.13 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  60.71 
 
 
223 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  44.25 
 
 
145 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  61.64 
 
 
220 aa  82.4  2e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  64.79 
 
 
220 aa  82  2e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  64.79 
 
 
220 aa  82.4  2e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  61.64 
 
 
220 aa  82  3e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  61.97 
 
 
216 aa  78.6  3e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  46.73 
 
 
143 aa  77.8  4e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  44.86 
 
 
145 aa  76.3  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  45.79 
 
 
143 aa  76.3  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  47.56 
 
 
212 aa  72.8  2e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  68.97 
 
 
66 aa  71.6  4e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>