More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1152 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  77 
 
 		 560 aa  823    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  75.71 
 
 		 559 aa  810    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  100 
 
 		 558 aa  1130    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  71.76 
 
 		 607 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  61.25 
 
 		 557 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  68.45 
 
 		 555 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.65 
 
 		 567 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  50.09 
 
 		 655 aa  500  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  51.54 
 
 		 585 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  50 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.64 
 
 		 604 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  48.82 
 
 		 580 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  46.98 
 
 		 611 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  45.82 
 
 		 588 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.05 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  44.59 
 
 		 569 aa  422  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  42.23 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  42.57 
 
 		 575 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  42.7 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.62 
 
 		 722 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  37.86 
 
 		 602 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.26 
 
 		 530 aa  364  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  43.84 
 
 		 583 aa  362  9e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.8 
 
 		 560 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  38.83 
 
 		 529 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  41.04 
 
 		 597 aa  355  8.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  38.21 
 
 		 560 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  38.83 
 
 		 529 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  38.83 
 
 		 529 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  38.64 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  38.64 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  38.4 
 
 		 529 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  39.67 
 
 		 571 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  38.45 
 
 		 529 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  38.26 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.94 
 
 		 529 aa  349  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  39.13 
 
 		 529 aa  349  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.26 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  38.94 
 
 		 529 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  38.94 
 
 		 529 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  38.68 
 
 		 529 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  38.94 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  38.94 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  38.94 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  38.64 
 
 		 529 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  37.69 
 
 		 529 aa  346  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  38.19 
 
 		 529 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  35.73 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  35.54 
 
 		 580 aa  296  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.38 
 
 		 571 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.24 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  30.69 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  34.45 
 
 		 1512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  31.57 
 
 		 574 aa  267  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.8 
 
 		 731 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  33.92 
 
 		 1577 aa  257  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  32.99 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.74 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.45 
 
 		 1525 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  35.06 
 
 		 1652 aa  243  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 586 aa  243  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  33.72 
 
 		 1577 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  31.72 
 
 		 1311 aa  242  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  34.98 
 
 		 870 aa  239  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  31.92 
 
 		 1506 aa  236  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  32.62 
 
 		 583 aa  236  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  32.38 
 
 		 1591 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  31.83 
 
 		 752 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.48 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.47 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  30.92 
 
 		 690 aa  201  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  29.57 
 
 		 826 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  29.07 
 
 		 765 aa  187  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.62 
 
 		 517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.64 
 
 		 1181 aa  178  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  28.76 
 
 		 530 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.49 
 
 		 1175 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  30.83 
 
 		 518 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  30.83 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.83 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  30.89 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.89 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.18 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.98 
 
 		 1215 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.26 
 
 		 872 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.98 
 
 		 1202 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.27 
 
 		 516 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.73 
 
 		 607 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  27.99 
 
 		 533 aa  160  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.37 
 
 		 605 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.18 
 
 		 558 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.33 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.96 
 
 		 1284 aa  150  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.01 
 
 		 555 aa  150  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.58 
 
 		 539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  26.54 
 
 		 750 aa  147  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  28.22 
 
 		 659 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.9 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.68 
 
 		 509 aa  140  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>