213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1147 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  100 
 
 		 246 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  79.17 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  78.28 
 
 		 246 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  78.19 
 
 		 245 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  79.17 
 
 		 251 aa  348  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4461  hemolysin A  78.75 
 
 		 246 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  76.13 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  54.17 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  48.54 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  52.5 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  51.67 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  54.58 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  52.5 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  48.36 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  45.04 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  50 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  54.39 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  48.95 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  48.99 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  49.16 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  46.61 
 
 		 264 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  49.18 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  47.11 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  45.23 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  45.23 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  44.63 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  45.87 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  46.09 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  48.77 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  45.04 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  45.12 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  47.54 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  41.1 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  43.27 
 
 		 270 aa  191  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  48.52 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  46.78 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  47.68 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3820  hemolysin A  50.21 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  43.6 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  43.6 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  45.76 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  41.95 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  47.11 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  42.8 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  43.6 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  43.6 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  43.6 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  43.6 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  43.6 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  44.35 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  45.83 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  43.75 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  43.2 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  45.08 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  42.56 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  42.56 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  43.57 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  40.91 
 
 		 272 aa  185  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2377  hemolysin A  52.24 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  43.27 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  46.09 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  43.72 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  46.69 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  41.63 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  44.03 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  43.15 
 
 		 269 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  44.9 
 
 		 267 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  40.59 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  45.99 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  42.51 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  45.42 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  42.56 
 
 		 248 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  44.73 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  43.57 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  41.53 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  45.23 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  39.74 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  41.87 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  44.73 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  43.57 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  42.68 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  40.24 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0401  hemolysin A  40.74 
 
 		 250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  41.74 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  39.41 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  41.77 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  48.35 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  40.33 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  42.08 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  42.86 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  40.98 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0688  hemolysin A  39.32 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000097723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  43.09 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  40.91 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  41.32 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  39.92 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0604  hemolysin A  43.62 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30581  normal  0.619961 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  41.94 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  42.92 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  37.7 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.63638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>