15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1125 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  33.95 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  32.12 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  30.3 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  40.96 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  30.32 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  37.84 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  44.07 
 
 		 567 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  34.43 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  43.1 
 
 		 347 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  27.67 
 
 		 349 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  36.96 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  28.16 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  35.53 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>