More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1045 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  69.98 
 
 		 477 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  100 
 
 		 478 aa  949    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  69.98 
 
 		 477 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  30.22 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 493 aa  236  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 475 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 475 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 475 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  32.56 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  32.35 
 
 		 489 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  32.35 
 
 		 489 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  32.35 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 482 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  30 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 478 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 507 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 471 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.88 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  24.87 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  25.59 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  25.87 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  24.09 
 
 		 480 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  23.67 
 
 		 452 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  26.41 
 
 		 459 aa  90.9  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.27 
 
 		 438 aa  90.1  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 465 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 465 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  23.82 
 
 		 471 aa  86.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.31 
 
 		 526 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  27.43 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  23.2 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  23.52 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  27.18 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  27.18 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  27.36 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  23.7 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  24.81 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  24.78 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  25.96 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  24.81 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  24.12 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  23.58 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  24.68 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  24.64 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  25.79 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  25.79 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  24.05 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  26.25 
 
 		 468 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  25.89 
 
 		 497 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  23.26 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  25.56 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.47 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.64 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  25.56 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  23.57 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  24.21 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  24.26 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  23.54 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  25.74 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>