46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1043 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 		 295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  73.22 
 
 		 295 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  73.22 
 
 		 295 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  73.22 
 
 		 295 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  66.9 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  66.55 
 
 		 292 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  66.9 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  66.55 
 
 		 292 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  66.55 
 
 		 292 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  65.51 
 
 		 292 aa  364  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.584894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  65.51 
 
 		 292 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  65.51 
 
 		 292 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  65.51 
 
 		 292 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  65.51 
 
 		 292 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  65.51 
 
 		 292 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  56.29 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  52.3 
 
 		 289 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  28.38 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.7 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.52 
 
 		 336 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.71 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  28.71 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  25.71 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.24 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.48 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  28.8 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  29.05 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.77 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  25.68 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  27.74 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.43 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.43 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.33 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.17 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.27 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.27 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.39 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.31 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  32.05 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.69 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.91 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.55 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.53 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.96 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0886  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.82 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.73 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>