More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0961 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  69.83 
 
 		 233 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  66.52 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  65.95 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  45.85 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  30.22 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 237 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  39.19 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  38.02 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  40.21 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  41.45 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  36.41 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.65 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  32.03 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  32.03 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  32.03 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  30.87 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  36.42 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  32.9 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  31.28 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  35.26 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  32.76 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  35.67 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  38.86 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  31.1 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.24 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.28 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.25 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  26.61 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  31.95 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  30.16 
 
 		 285 aa  75.1  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.93 
 
 		 259 aa  72  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  29.79 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.48 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.43 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.11 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  36.24 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.03 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.69 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  26.84 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  26.55 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>