More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0887 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 504 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  63.11 
 
 		 528 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  61.48 
 
 		 527 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  60.99 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.03 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.85 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  71.3 
 
 		 518 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  67.14 
 
 		 541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.73 
 
 		 292 aa  259  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.57 
 
 		 295 aa  239  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.79 
 
 		 291 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.89 
 
 		 291 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  48.88 
 
 		 287 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  48.89 
 
 		 288 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.09 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  46.82 
 
 		 523 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.56 
 
 		 554 aa  183  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  41.63 
 
 		 535 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.73 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  38.91 
 
 		 570 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.81 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  31.95 
 
 		 276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 576 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.29 
 
 		 478 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  34.66 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.9 
 
 		 515 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.95 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.11 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.68 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.08 
 
 		 862 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.64 
 
 		 1026 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 		 859 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.98 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  31.8 
 
 		 798 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.48 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 828 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.11 
 
 		 495 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  32.56 
 
 		 449 aa  120  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.23 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.61 
 
 		 680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.88 
 
 		 915 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.35 
 
 		 728 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 860 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  29.79 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  32.35 
 
 		 472 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.05 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.18 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 		 718 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  31.68 
 
 		 619 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.4 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 713 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.66 
 
 		 824 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.87 
 
 		 776 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.35 
 
 		 1056 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  29.96 
 
 		 477 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.28 
 
 		 708 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.78 
 
 		 813 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  28.79 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.02 
 
 		 497 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.74 
 
 		 839 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.86 
 
 		 629 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.51 
 
 		 818 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1650  TPR repeat-containing protein  42.95 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.56 
 
 		 778 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.3 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.09 
 
 		 988 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.71 
 
 		 784 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.67 
 
 		 971 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  27.67 
 
 		 971 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  30.04 
 
 		 657 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.83 
 
 		 1022 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 		 649 aa  99  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 		 1056 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.19 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.18 
 
 		 373 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.5 
 
 		 766 aa  93.2  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.98 
 
 		 654 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  39.67 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.66 
 
 		 1155 aa  90.5  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.7 
 
 		 462 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.01 
 
 		 820 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  29.51 
 
 		 482 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 260 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 		 295 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.11 
 
 		 261 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 249 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.71 
 
 		 249 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.8 
 
 		 219 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 279 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  32.21 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.06 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  27.12 
 
 		 616 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.76 
 
 		 706 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 1421 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>