More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0846 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
255 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49 
 
 
290 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03360  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.68 
 
 
278 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.89 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
255 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
278 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
280 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  38.31 
 
 
285 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
281 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
273 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
284 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
273 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
259 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00307443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.22 
 
 
271 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
279 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
270 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
272 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
272 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  35.17 
 
 
263 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
270 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
270 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
270 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
270 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
273 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
273 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  35.51 
 
 
284 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.13 
 
 
270 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  35.51 
 
 
284 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
280 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  35.51 
 
 
284 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
279 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
273 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  35.71 
 
 
280 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
264 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  33.88 
 
 
279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
300 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
283 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  37 
 
 
272 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
264 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
273 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
273 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
273 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
259 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
273 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
273 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
273 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
315 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
264 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
268 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.45 
 
 
277 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
279 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
268 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
275 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
277 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  33.47 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  37.44 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  33.47 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
277 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
274 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
282 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
251 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
263 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  34.87 
 
 
274 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
260 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1153  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.23101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
294 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
279 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  34.87 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  34.45 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  34.87 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  34.87 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
265 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  33.33 
 
 
273 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
273 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  34.39 
 
 
275 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  32.79 
 
 
256 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
263 aa  134  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  34.45 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.47 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>