More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0814 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  95.3 
 
 		 298 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  94.97 
 
 		 298 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  93.96 
 
 		 298 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  93.29 
 
 		 298 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3700  acetylglutamate kinase  92.28 
 
 		 298 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3071  acetylglutamate kinase  90.6 
 
 		 298 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  72.47 
 
 		 304 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  72.82 
 
 		 304 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  67.88 
 
 		 294 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  67.24 
 
 		 305 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  70.73 
 
 		 298 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  67.11 
 
 		 297 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  70.73 
 
 		 298 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  70.03 
 
 		 298 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  71.08 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  66.67 
 
 		 295 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  67.02 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  65.96 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  68.48 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  65.96 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  64.56 
 
 		 301 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  67.13 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  67.13 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  67.47 
 
 		 296 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  64.95 
 
 		 304 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  63.07 
 
 		 336 aa  357  9e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  62.85 
 
 		 310 aa  341  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  56.66 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  56.1 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  58.7 
 
 		 301 aa  330  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4558  acetylglutamate kinase  57.24 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  59.17 
 
 		 302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  53.66 
 
 		 298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  52.6 
 
 		 292 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  53.29 
 
 		 292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  48.46 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  51.04 
 
 		 285 aa  301  6.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  51.76 
 
 		 301 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  51.76 
 
 		 301 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  51.4 
 
 		 301 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  52.23 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  52.23 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  52.96 
 
 		 292 aa  298  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  51.06 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  48.43 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  51.56 
 
 		 292 aa  295  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  51.55 
 
 		 292 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  48.44 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  48.79 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 290 aa  292  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 290 aa  292  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 300 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  50.34 
 
 		 295 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  51.4 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  49.49 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  50 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  47.9 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  51.19 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  53.15 
 
 		 287 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.491958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  48.98 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 293 aa  285  9e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  48.25 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  48.26 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  48.26 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  49.5 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  49.13 
 
 		 302 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  48.32 
 
 		 300 aa  281  7.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  48.58 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  48.26 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  46.64 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  48.32 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  49.33 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  51.92 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0594  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0675136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  49.31 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  48.6 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0444  acetylglutamate kinase  49.65 
 
 		 323 aa  276  2e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  48.46 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  48.96 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  47.92 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  47.42 
 
 		 300 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  51.75 
 
 		 286 aa  275  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  48.45 
 
 		 300 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  48.12 
 
 		 299 aa  275  7e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  47.81 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  47.99 
 
 		 296 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0306  acetylglutamate kinase  53.68 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.531826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>