113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0812 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  85.27 
 
 		 236 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  83.04 
 
 		 233 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  81.94 
 
 		 233 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  78.03 
 
 		 237 aa  363  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  77.83 
 
 		 231 aa  357  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  73.5 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  61.01 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.61 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.89 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  52 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.74 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.7 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.08 
 
 		 268 aa  234  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  51.56 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  53.3 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.51 
 
 		 243 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.39 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.18 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.56 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.36 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.84 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.84 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.27 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.83 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  44.25 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  40.72 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  41.7 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.6 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  43.94 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.59 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.92 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  39.46 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.18 
 
 		 215 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.99 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.73 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  39.73 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  39.91 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  40.66 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.92 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.52 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  34.57 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.6 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.04 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.04 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  29.28 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.15 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  29.12 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  32.24 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.06 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  34.05 
 
 		 322 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  33.92 
 
 		 334 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.35 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  32.43 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.43 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  29.57 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.89 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.27 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.18 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.11 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.11 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  29.73 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  29.56 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  26.37 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  32.06 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  25.41 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  24.14 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  32 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.87 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.16 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1231  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  32.2 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  32.29 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.18 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.39 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  23.31 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  26.23 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.67 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1956  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.17 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0682  HAD hydrolase, family IA, variant 3  27.48 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  26.84 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  31.18 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.16 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.23 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  30 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.87 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>