85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0746 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0746  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.895245  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0876  metallophosphoesterase  79.58 
 
 
240 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0798  metallophosphoesterase  82.38 
 
 
239 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235454  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0241  metallophosphoesterase  78.54 
 
 
231 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4612  hypothetical protein  75.98 
 
 
232 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0186  metallophosphoesterase  70.46 
 
 
241 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0998122  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0803  hypothetical protein  68.37 
 
 
227 aa  304  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2051  metallophosphoesterase  57.73 
 
 
235 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.706568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0028  metallophosphoesterase  57.87 
 
 
233 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0616  hypothetical protein  52.31 
 
 
242 aa  232  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4759  putative ICC-like phosphoesterase  57.21 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0538  metallophosphoesterase  56.02 
 
 
237 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4250  putative ICC-like phosphoesterase  56.74 
 
 
237 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887431  normal  0.946064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0264  hypothetical protein  53.18 
 
 
239 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0409149 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0825  hypothetical protein  53.99 
 
 
238 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0000998399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3155  putative ICC-like phosphoesterase  55.4 
 
 
237 aa  225  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3479  putative ICC-like phosphoesterase  55.4 
 
 
237 aa  224  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0774  hypothetical protein  53.52 
 
 
238 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4041  hypothetical protein  54.46 
 
 
238 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0373  hypothetical protein  53.99 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0531  metallophosphoesterase  53.46 
 
 
235 aa  214  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0454  putative ICC-like phosphoesterase  50.66 
 
 
238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3351  putative ICC-like phosphoesterase  54.93 
 
 
239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264147  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0233  metallophosphoesterase  50.94 
 
 
241 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0152  metallophosphoesterase  49.34 
 
 
241 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0203  putative phosphoesterase protein  50.47 
 
 
242 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1453  hypothetical protein  49.3 
 
 
237 aa  188  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0437211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0985  hypothetical protein  49.49 
 
 
220 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.280922  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1118  hypothetical protein  46.86 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0573  ICC-like putative phosphoesterase  43.29 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0659  putative metallo-phosphoesterase  46.19 
 
 
228 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2312  metallophosphoesterase  46.19 
 
 
228 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.198359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1614  ICC-like protein putative phosphoesterase  46.83 
 
 
225 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3548  ICC-like protein putative phosphoesterase  43.65 
 
 
220 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2537  ICC-like phosphoesterases-like  46.51 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3028  metallophosphoesterase  45.96 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00671  metallophosphoesterase  39.69 
 
 
234 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0597826  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0414  putative metallo-phosphoesterase  41.84 
 
 
218 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1757  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  31.22 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3881  hypothetical protein  32.2 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65628  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  31.38 
 
 
216 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.815111  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0731  serine/threonine specific protein phosphatase  29.14 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.148819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4856  metallophosphoesterase  33.71 
 
 
227 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6865  metallophosphoesterase  33.71 
 
 
215 aa  85.5  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.999179  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0355  metallophosphoesterase  32.26 
 
 
227 aa  85.5  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1852  hypothetical protein  32.13 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4459  metallophosphoesterase  33.51 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238847  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0377  metallophosphoesterase  31.02 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0777  putative phosphoesterase  32.12 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261984  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2962  metallophosphoesterase  34.03 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000570828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1131  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595514  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2564  ICC-like putative phosphoesterase  32.29 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1102  hypothetical protein  32.65 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02260  hypothetical protein  28.42 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4142  hypothetical protein  29.27 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08611  Serine/threonine specific protein phosphatase  29.67 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.550698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1204  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
218 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0767  hypothetical protein  34.78 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0313  metallophosphoesterase  32.18 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1339  metallophosphoesterase  32.09 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3526  ICC-like phosphoesterase  29.9 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1142  ICC-like protein putative phosphoesterase  31.63 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.221625  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0308  metallophosphoesterase  31.16 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0944102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3046  metallophosphoesterase  31.1 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0160441  normal  0.430681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2193  ICC-like putative phosphoesterase  29.65 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0751085  hitchhiker  0.00311079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3331  metallophosphoesterase  29.53 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1516  hypothetical protein  31.38 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1889  hypothetical protein  32.29 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6752  metallophosphoesterase  32.76 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3549  ICC-like putative phosphoesterase  28.88 
 
 
241 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01734  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.87 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4310  ICC-like putative phosphoesterase  31.16 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601938  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1509  phosphoesterase, putative  27.14 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0181928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2823  hypothetical protein  32.04 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117431  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0316  phosphoesterase  28.22 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0534  phosphoesterase, putative  26.67 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.988231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3146  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0259204  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1526  metallophosphoesterase  25.41 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.0019874  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0464  metallophosphoesterase  21.69 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0118793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0443  metallophosphoesterase  23.78 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0393  metallophosphoesterase  23.53 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1928  phosphoesterase  25.12 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1310  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0546  metallophosphoesterase  26.41 
 
 
251 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0574725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>