235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0741 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  590  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  88.27 
 
 		 307 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  86.32 
 
 		 307 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  84.82 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  81.11 
 
 		 308 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  80.46 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  81.05 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  58.03 
 
 		 308 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  56.15 
 
 		 307 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  56.15 
 
 		 305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  55.15 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  55.81 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  61.18 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  52.92 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  52.15 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  51.15 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  52.26 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  56.15 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  52.82 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  54.85 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  52.49 
 
 		 306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  54.52 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  57 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  53.49 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  52.49 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  50.5 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  56.68 
 
 		 307 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  43.19 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  44.85 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  51.5 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  44.08 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  40.86 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  43.48 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  40.69 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  40.27 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  33.99 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  40.47 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  35.56 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.75 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  32.87 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  27.16 
 
 		 426 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  29.49 
 
 		 361 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  27.12 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  30.51 
 
 		 356 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  29.14 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  28.84 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  26.71 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  29.37 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  26.54 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  26.94 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  25.26 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  23.81 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.06 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  26.94 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  28.52 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  26.28 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  26.43 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  26.43 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  24.74 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  24.74 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  24.1 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  25.08 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  25.82 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  25.95 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  27.05 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  30.29 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  30.29 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  23.08 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  30.29 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.36 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.99 
 
 		 2798 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  24.72 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  28.78 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  24.83 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  27.7 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  28.06 
 
 		 360 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  25.09 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  24.21 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  23.97 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  29.5 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.4 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  24.65 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  28.91 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  28.91 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  25.29 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  24.1 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  24.1 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  24.49 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  26.36 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  27.38 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  25.95 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  24.31 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  23.67 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>