More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0660 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 800 aa  1540    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  35 
 
 		 739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  35 
 
 		 739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  44.83 
 
 		 335 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.31 
 
 		 732 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  44 
 
 		 315 aa  206  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  40.58 
 
 		 325 aa  204  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.94 
 
 		 740 aa  203  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  40.58 
 
 		 325 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.51 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  34.38 
 
 		 734 aa  198  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  35.46 
 
 		 756 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  43.45 
 
 		 305 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  38.98 
 
 		 321 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  41.75 
 
 		 329 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  39.58 
 
 		 365 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  34.63 
 
 		 779 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  34.63 
 
 		 779 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  34.43 
 
 		 782 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.27 
 
 		 730 aa  187  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.02 
 
 		 728 aa  187  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.75 
 
 		 735 aa  187  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.36 
 
 		 725 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.11 
 
 		 732 aa  184  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  40.56 
 
 		 320 aa  184  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  40.39 
 
 		 327 aa  183  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  40.72 
 
 		 327 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.45 
 
 		 725 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.75 
 
 		 736 aa  180  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.24 
 
 		 725 aa  180  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  41 
 
 		 330 aa  177  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  33.54 
 
 		 736 aa  177  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.76 
 
 		 727 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  38.89 
 
 		 327 aa  170  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  36.57 
 
 		 337 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  37.34 
 
 		 335 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  38.04 
 
 		 340 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0676  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  36.57 
 
 		 653 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0564  sulfite reductase, alpha subunit  36.57 
 
 		 653 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0948792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  38.83 
 
 		 331 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0565  ApbE family protein  51.48 
 
 		 404 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53612  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0677  ApbE family protein  51.48 
 
 		 404 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0780  ApbE family protein  51.48 
 
 		 404 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.725216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1630  ApbE family protein  51.48 
 
 		 404 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  35.25 
 
 		 338 aa  144  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  35.62 
 
 		 355 aa  144  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1982  ApbE family protein  50.87 
 
 		 394 aa  144  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.63389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0494  ApbE family protein  50.87 
 
 		 394 aa  144  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.11 
 
 		 349 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.51 
 
 		 337 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  38.19 
 
 		 287 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.05 
 
 		 732 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2079  ApbE family protein  50.3 
 
 		 394 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  31.74 
 
 		 349 aa  138  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 341 aa  138  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.2 
 
 		 350 aa  137  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  32.88 
 
 		 343 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  33.66 
 
 		 362 aa  135  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  26.25 
 
 		 354 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  28.24 
 
 		 338 aa  131  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  31.4 
 
 		 332 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  32.33 
 
 		 326 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 344 aa  127  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  32.45 
 
 		 326 aa  127  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  34.64 
 
 		 341 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  26.47 
 
 		 352 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2110  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.23 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.69 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  30.15 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  34.12 
 
 		 345 aa  125  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.15 
 
 		 341 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.1 
 
 		 343 aa  124  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  31.76 
 
 		 342 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.52 
 
 		 718 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.15 
 
 		 351 aa  123  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  27.69 
 
 		 337 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  29.9 
 
 		 341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.77 
 
 		 361 aa  122  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  31.76 
 
 		 342 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  37.79 
 
 		 348 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.42 
 
 		 351 aa  121  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  26.91 
 
 		 382 aa  120  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.77 
 
 		 351 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  29.54 
 
 		 334 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.42 
 
 		 337 aa  118  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  30.15 
 
 		 338 aa  118  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.1 
 
 		 351 aa  118  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 		 338 aa  118  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.91 
 
 		 350 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  31.18 
 
 		 344 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  26.77 
 
 		 351 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  26.77 
 
 		 351 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.77 
 
 		 351 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  26.77 
 
 		 351 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.77 
 
 		 351 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.69 
 
 		 349 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  27.89 
 
 		 379 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.21 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.91 
 
 		 350 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.91 
 
 		 350 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>