More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0636 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0636  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
389 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1373  acetyl-CoA acetyltransferase  69.59 
 
 
389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.94564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
389 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  48.27 
 
 
399 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  45.01 
 
 
396 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.52 
 
 
400 aa  332  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  43.48 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
403 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  44.13 
 
 
392 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
396 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
392 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
398 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  43.48 
 
 
395 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  45.92 
 
 
390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.24 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  42.6 
 
 
393 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
393 aa  320  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  43.48 
 
 
391 aa  317  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 
398 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45 
 
 
401 aa  316  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
394 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
390 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  49.35 
 
 
391 aa  315  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.97 
 
 
392 aa  315  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  43.62 
 
 
393 aa  315  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.75 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.75 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.14 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.75 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  44.31 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  41.79 
 
 
391 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  42.6 
 
 
392 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
391 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  45.38 
 
 
394 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  45.11 
 
 
392 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  45.38 
 
 
394 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  47.29 
 
 
392 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 
392 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  41.79 
 
 
391 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
391 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  45.01 
 
 
394 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
391 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.64 
 
 
390 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
391 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
391 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
391 aa  309  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  41.84 
 
 
392 aa  309  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
391 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  41.54 
 
 
391 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
391 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  44.13 
 
 
394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 
394 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
398 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  42.09 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.84 
 
 
414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  43.26 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  42.57 
 
 
390 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  45.86 
 
 
392 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  45.86 
 
 
392 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.96 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  44.86 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 
392 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  40.92 
 
 
393 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  45.59 
 
 
398 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  41.94 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  41.33 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  42.6 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  41.43 
 
 
394 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  41.84 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  45.11 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  45 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  44.9 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  40.97 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.75 
 
 
412 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.25 
 
 
405 aa  302  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  43.48 
 
 
391 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
393 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  43.11 
 
 
392 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
393 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
402 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.32 
 
 
404 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  41.58 
 
 
393 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>